大荒古碑の中で、林動は騰儡との戦いに勝利するが、元力の壁に囲まれた空間に閉じ込められてしまう。そんな林動の前に、穆仟仟の力を借りた騰刹が騰儡の復讐を果たそうと現れる。その頃、同じく古碑の中にいた林琅天と青檀は別の空間に閉じ込められていた。林琅天は青檀の寒毒を利用して脱出すると、空間護符を手に入れる。

空間護符の制御がなくなったことで、崩れ始めた大荒古碑。そこに閉じ込められていた林動と応歓歓たちは古碑の外にいる綾清竹たちと力を合わせ危機一髪のところで脱出に成功する。そして、林動は青檀が騰刹にさらわれたと知ると、空間護符も魔物と結託した騰刹が奪ったに違いないと考え、大傀城に戻ることにする。

清朝雍正帝（ようせい）の治政下、第四皇・子弘暦（こうれき）は自身の妻を選ぶ「福晋選び」に幼なじみの青桜（せいおう）を招請する。福晋選びの当日、母である熹貴妃（ききひ）の期待に反して、弘暦は青桜を正室である嫡福晋に選び、その証しの品の如意を授ける。同じ頃、雍正帝は第三皇子・弘時（こうじ）の二心を疑い皇籍を剥奪、続いてその母である皇后・烏拉那拉（ルビ：ウラナラ）氏にも生涯禁足の刑を言い渡す。更に雍正帝は皇后の姪にあたる青桜との婚姻を考え直すよう弘暦に強く迫るのだった。

青桜が側福晋として弘暦の王府に輿入れしてから6年の歳月が過ぎた頃、かねてより病気がちだった雍正帝が崩御する。これにより弘暦が帝位を継ぐと、雍正帝の唯一の皇后だった烏拉那拉氏に、皇帝の嫡母としての尊号を与えるべきだという声が朝廷から上がる。この話を耳にした弘暦の母・ニオフル氏は憤慨し、あからさまに青桜に八つ当たりをする。そして烏拉那拉氏が二度と再起できぬよう、青桜に究極の選択を迫るのだった。

先帝皇后・烏拉那拉氏を排除しようとする皇太后・ニオフル氏は、景仁（けいじん）宮に幽閉されている彼女に密かに毒を渡していた。は烏拉那拉氏は一族の将来を青桜に託し、毒をあおって死んでいく。叔母の死を目の当たりにした青桜だが、弘暦にその死因を問い詰められても皇太后の関与はおくびにも出さず、あくまでも先帝崩御を悲しんだあまりの急死だと言い張るのみだった。新帝の即位式が済み、皇太后が慈寧（じねい）宮へ移る準備が進められるが…。

青桜は乾隆帝（けんりゅう）が皇太后を慈寧宮へ移さずにいることを知る。そんな中、乾隆帝から青桜のもとへ如意結びと2人の思い出の芝居「牆頭馬上（しょうとうばじょう）」の楽譜が届けられる。一計を案じた青桜は、禁足の身でありながら乾隆帝を訪ね、皇太后に孝を尽くすよう説得する。その甲斐あって、慈寧宮へ移ることになった皇太后は青桜の禁足を解く。更に自らの名を捨てて生まれ変わりたいと言う青桜に、皇太后は「如懿（にょい）」という名を与えるのだった。

西洋の男性が1人の妻しか娶れないという話を宮廷画家の郎世寧（ろうせいねい）から聞いた如懿。乾隆帝に一夫一妻は理想的なことだと話し、怒りを買ってしまう。これにより乾隆帝は延禧（えんき）宮から足が遠のくが、結局は自らしたためた絵や書を如懿に贈り、仲直りをする。一方、富察（ルビ：フチャ）皇后は後宮に莫大な経費がかかっているとし、贅沢はやめて倹約するよう妃嬪たちに申し渡す。そんなある日、乾隆帝は琵琶の奏者である白蕊姫（はくずいき）という美しい女子に目をつけ…。

如懿の侍女・アジャクは、如懿だけが皇帝直筆の扁額（へんがく）を賜ったことを内務府（ないむ）で自慢げに言いふらす。その話は富察皇后や慧貴妃（けいきひ）の耳にも入り、嫉妬にかられた慧貴妃は、自分も直筆の扁額を手に入れようと乾隆帝に直談判に行く。如懿だけを特別扱いするなと、扁額をねだられた乾隆帝は、后妃たちそれぞれに書を下賜（かし）する。そんなある晩、執務を終えた乾隆帝は夜伽（よとぎ）の相手を後宮の后妃から選ばず、琵琶奏者の白蕊姫を呼べと王欽（おうきん）に伝えるのだった。

冷え性の慧貴妃に炭を横取りされて寒さに震える海常在（ルビ：ハイじょうざい）のために、如懿はひそかに炭を届ける。その様子を目撃して腹を立てる慧貴妃に、嘉貴人（かきじん）は海常在を陥れる策を献じる。ある雪の夜、慧貴妃は海常在が上位の妃にだけ使用を認められているコウラ炭を盗んだと濡れ衣を着せ、処罰しようとする。如懿は慌てて駆けつけるが、侍女の偽証により海常在は窮地に立たされてしまう。そこへ騒ぎを聞きつけた乾隆帝と皇后が現れる。

慧貴妃に無礼を働いた罰として頬をたたかれた白蕊姫は、頬に侍医院から処方された薬を塗っていた。ところが頬の腫れは引くどころか、逆に傷ができてしまう。乾隆帝が侍医を呼び調べさせたところ、肌に有毒な瑠璃茉莉（るりまつり）が混入されていることが判明する。白蕊姫は如懿が嫉妬から毒を盛ったに違いないと言い張るが、海常在は如懿の仕業であるはずがないと主張。如懿が帯びている香り袋には瑠璃茉莉は入っていないと言うのだった。

如懿が寵愛を得たことで、内務府から贈り物が続々と延禧宮に運び込まれる。乾隆帝からも緑梅の鉢が届き、如懿は喜びながらも侍女たちに自慢を慎むよう釘を刺す。一方、毒入りの薬で顔に傷を作ったマイトウオウだが、実はその背後には後宮の実権を握りたい皇太后の思惑があった。皇太后は新年の挨拶の席で、即位後初の皇子を早く産むよう后妃たちに期待をかける。子宝に恵まれない慧貴妃は、母親を亡くした第一皇子を引き取ることを思いつく。

自身の誕辰祝いの席上で如懿は乾隆帝に、彼の生母・李金桂（りきんけい）の追贈と妃陵への改葬を願い出る。だが生母が一介の女官であるという出生の秘密を隠しておきたい乾隆帝は、これをはぐらかす。それでも食い下がる如懿に対して乾隆帝は、その思いを理解するどころか、激しい怒りをぶつけて席を立ち、海常在の部屋でその夜を過ごす。皇帝の寵愛を失ったと見なされ、内務府からの手当が滞った如懿は、厳しい暮らしを強いられるのだった。

ケツホウ殿でろくに世話をされていなかった第一皇子のエイコウは、乾隆帝の希望もあり、如懿の養子として延禧宮に住むこととなる。皇后は如懿が乾隆帝の長子を手に入れ、寵愛を取り戻したことに脅威を感じ、エイコウの乳母だった女官を潜り込ませようとする。だが如懿は乳母を厳罰に処し、皇宮から追放してしまう。一方、嘉貴人は如懿に対する皇后の不安をあおったうえで、養心（ようしん）殿の王欽を取り込むため、侍女の蓮心（れんしん）を嫁がせてはどうかと提案する。

入内してまだ半年のマイジョウザイは早々に乾隆帝の子を身ごもる。皇后のご機嫌伺いに集まった妃嬪たちの前で、得意げに懐妊の報告をし、身ごもらない妃嬪たちに皮肉まで言い放つ。一方、皇后は蓮心と王欽の結婚を正式に発表する。蓮心は皇后の意向に逆らうこともできず、泣く泣く年の離れた太監のもとへ嫁ぐことに。だが婚礼の夜、２人の新居らしき所から女性の叫び声が聞こえてきたため、後宮ではさまざまな臆測が飛び交うのだった。

林動と奇物楼を訪れた応歓歓。岩大師に会ってもらえない林動を助けようと、父親の令牌を盗みに戻る。だが、師兄の悟道に見咎められ、一緒に下山するはめになる。一方、林動は青檀の寒毒の発作を治すための薬・陰龍涎が手に入るという小貂の口車に乗せられ、彼と奇物楼へ侵入。しかし、そこには様々な仕掛けが施されており…。

奇物楼から林動たちを逃したのは林琅天だと見抜いた岩大師。彼は林琅天に林動を符師会に勧誘したのは修練の手ほどきをしたいからだと話す。一方、小貂は林動に陰龍涎を飲み込んだ炎虎を殺し、その血で薬を練ろうと主張する。するとその時、赤い閃光が走り炎虎は人の姿へと変化する。炎虎が飲んだのは化形丹だったのだ。

岩大師が太清宮に護符の継承者を守る役目を担う符使の派遣を要請。そこで沈清は符使の選抜を行う。それを綾清竹は知らされていなかったが、強引に選抜の競技に参加して見事符使に選ばれる。一方、穆仟仟から生身の人間を符傀にする術を教わった騰儡。彼は穆仟仟にそそのかされ、父親の反対を押し切って炎城へ向かう。

大乱闘となった奇物楼で林動は騰儡を仕掛けに誘い込み、檻に閉じ込めることに成功する。そこで林動が調子に乗って綾清竹の手を握り続けていると、彼女の持つ本命霊符が彼に共鳴。それを見た岩大師は林動を正式に継承者に任命する。符師会の会長となった林動は、騒動を起こしたおわびと挨拶代わりに弟子たちに陽元丹を振る舞う。

継承者の重責を知って一度は符師会の会長になることを拒んだ林動。だが、岩大師から青檀の寒毒の治療を始めとする3つの約束を取りつけ、会長に就任することを最終的に受け入れる。その後、岩大師は約束どおり青檀を診察。青檀の寒毒は生まれついた一種の元力のような力であり、その力は暗黒殿から来ていることがわかる。

林の中で魔物に遭遇した林動と応歓歓。そこに林琅天と綾清竹が助けに現れる。その頃、奇物楼も何者かに襲撃されていた。そして、犯人の手がかりを見つけたという萱素についていった林動は、符術に操られた彼女に襲われる。結局、萱素は岩大師の力で正気に戻るが、その時には奇物楼のすべての弟子に影響が及んでいた。

弟子を助けるため、郊外に建つある達人の古墓に入った林動たち。そこには思わぬ仕掛けがあり、林動と綾清竹は2人きりで石の棺の中に閉じ込められてしまう。だが、小貂の助けで何とかそこから脱出。そして、探していた“涅槃心”を見つけるが、それを手にした綾清竹が墓の主に取り憑かれてしまい、林動を誘惑し始める。

穆仟仟と騰儡により化生池に捨てられた林動。その危機を察知した岩大師は、授けておいた元丹を使い林動の精神世界へ入る。そして、青檀たちの助けもあり九死に一生を得た林動は、奇物楼に帰還する。だが、奇物楼の惨事と負傷した岩大師を見た弟子たちが、林動は符師会の会長にふさわしくないのではないかと言い始める。

岩大師や弟子たちに迷惑をかけた林動は心を入れ替え、年に１度開催される塔闘に向け本格的な修練をすることに。その指導を林琅天が買って出る。2人はかつての兄弟愛を取り戻し、心を通わせたように見えたが、すべては穆仟仟が裏で糸を引いていた。一方、小貂は呑噬護符の中にいたが、新たな持ち主となった騰儡に腹を立てる。

綾清竹は一連の出来事により元丹を傷つけて降級。そのことを林動には言わないようにと応歓歓に口止めするが、そんな彼女を太清宮に連れ戻そうと、沈清と蘇柔が奇物楼にやってくる。それを拒んだ綾清竹は、3日の間に必ず元丹を修復すると宣言。この騒ぎで綾清竹の苦境を知ってしまった林動は、自責の念に駆られる。

林動から与えられた涅槃心で元丹を練り直し、回復した綾清竹。だが、岩大師はそのことを知るや、符師会の会長の座を降りて炎城を去れと林動を激しく叱責する。綾清竹が林動をかばい自分の非を認めるが、岩大師の怒りは表向きで実は林動の純粋さを評価していた。一方、林琅天は林動と穆仟仟の板挟みになり、葛藤する。

塔闘の当日、雷に打たれ続け、死ぬ思いで天元境に昇級した林動。先に出発した岩大師たちに追いつくと、塔闘の勝負に名乗りを上げる。そして、規定どおり林動が神動篇を唱えて符師塔を開けることになるが、それを暗記できていない彼は慌てる。だが、岩大師は密かに助っ人を用意していた。小貂の助けで林動が神動篇を唱えると…。

「北の空に凶兆が現れました――永夜が訪れます」。衛光明（えい・こうめい）は、冥王の子を討って昊天の民を救うべきだと進言する。彼の持つ不思議な力は、冥王の子が唐（とう）国の林（りん）府にいることを示していた。一方、唐国では、戦場でのある出来事をめぐり、林将軍と夏候（か・こう）将軍が対立し…。

天啓15年、金帳王庭（きんちょうおうてい）の単于（ぜんう）が急逝し、唐（とう）国から嫁いだ李漁（り・ぎょ）が殉葬されることに。彼女は密かに逃走を試みるが、計画はあえなく露見してしまう。差し向けられた追っ手に馬車を包囲され、万事休すかと思われたその時、何者かが放った短刀が生き物のように宙を舞い…。

渭（い）城の馬（ば）李将軍は、渋る李漁（り・ぎょ）を説得し、彼女を都まで護送する案内役に寧缺（ねい・けつ）を据えた。一方、李漁が金帳王庭（きんちょうおうてい）を脱出したことを知った唐（とう）国の夏候（か・こう）大将軍は、妹・夏天（か・てん）の身を案じ「李漁はお前の命を狙うぞ」と忠告し…。

「命の恩人でも、あなたのことは大嫌いよ」と言い放った李漁（り・ぎょ）だったが、寧缺（ねい・けつ）への態度には、それまでのとげとげしさが消えていた。２人は焚火を見つめながら、夜が更けるのも構わずに互いの境遇を語り合うのだった。そんななか、唐（とう）の都では夏候（かこう）が謀反の疑いで捕縛され…。