シンから1年前に戻って人生をやり直す“リセット”の機会を与えられたヒョンジュとガヒョンは、半信半疑ながらも参加を決める。1年前に戻ったヒョンジュは、ソノを殺した犯人を捕まえ事件を未然に防ぐことに成功。一方、自身の足で歩ける喜びを噛み締めていたガヒョンだったが、犬の散歩を終え帰宅した家で、最悪の光景を目にしてしまう。

一堂に介した9人のリセッターは、パク・ヨンギルがリセットの瞬間に事故で死亡したと知らされて衝撃を受ける。ガヒョンは健康な身体を取り戻すが、婚約者が親友ミン・ジュヨンと浮気をしていた事実を知り落ち込んでいた。そんな中、ガヒョンが1年前にひき逃げ事故に遭った日が訪れる。彼女は無事だったが、その代わりに思いがけないことが…。

ひき逃げ犯を突き止めようと奔走するヒョンジュとガヒョン。シンの催眠療法で断片的な記憶が蘇ったガヒョンは、リセッターの1人であるソ・ヨンスが自分を轢いた犯人だと確信する。ガヒョンは真相を聞くためにシンの元を訪れるが、何も聞き出せない。そんな中、またリセッターのチェ・ギョンマンが亡くなり、参加者を恐怖に陥れるが…。

ヨンスの変死体が発見される。ヒョンジュは死亡時刻の直前にヨンスと言い争っていたガヒョンをやむなく容疑者として逮捕。ソノの取り調べを受けたガヒョンは、ヨンスの婚約者がひき逃げ事故の犯人だと訴えるが、警察に記録のない情報をなぜ知っているのかと余計に怪しまれてしまう。さらにヒョンジュとガヒョンが顔見知りだとバレて…。

次々とリセッターが謎の死を遂げる中、ヒョンジュはリセッターのチャ・ジュンソクから死のルールを聞き、次に死ぬかもしれないペ・ジョンテを探して欲しいと頼まれる。さらに、ヒョンジュはヨンスがジョンテと面識があったことを突き止め、2人は以前からリセットを知っていたのではないかと推測。一方、ガヒョンは、シンと会い真相を探るが…。

リセットの秘密を突き止めるために手を組んだヒョンジュとガヒョン。ジョンテがリセッター全員を監視していたと知ったガヒョンは、シンの指示で動いていたのではないかと疑い、彼女の自宅へ向かうが、外国に行ったと聞かされる。一方、ヒョンジュはジュンソクがジョンテに恐喝されていたと知り、ジョンテの携帯電話に盗聴器を仕掛けるが…。

ジュンソクの退職祝いに本人が現れず、心配するリセッターたち。さらにジョンテが自分たちを監視していたと聞き、ますます恐怖心を強める。そんな中、ジュンソクの遺体が遺書とともに発見されるが、ヒョンジュは彼が自殺したとは思えずにいた。ガヒョンもジュンソクの家の玄関にこれまで死んだ人と同じ花かごが置かれているのを発見し…。

帰国したシンからの連絡を受け集まったリセッターたちの元に、死を予告する花かごが届く。ヒョンジュとガヒョンはシンやジョンテを疑うが、その花かごはプロゲーマーのコ・ジェヨンが犯人を見つけるために送った偽物であることが判明。さらに調査を続けていた2人は、リセッター候補だったある人物と関係していることを突き止めるが…。

リセットへの参加を辞退したソ・ヘインの生花店から、花かごが送られていたことを探し当てたヒョンジュとガヒョン。依頼されただけだと話すヘインに、次の注文が入ったら知らせて欲しいとお願いする。そして、ガヒョンは花に添えられていたカードがそれぞれの死因を示していることに気づいた矢先、ヘインの元に新たな花かごの依頼が入り…。

生花店のガス爆発によってヘインが死亡する。ヒョンジュとガヒョンはシンの元を訪れ、室長のソン・ジヒョンに花かごを注文させたのではないかと問い詰める。シンは何も知らないと言い、ジヒョンが自分に「運命のかけらたち」という本を渡して病院を辞めたと話す。打つ手がなくなったヒョンジュたちは、一から事件を洗い出すことにするが…。

シンが姿を消し、突然リセッターたちの元にカードが届く。ヒョンジュとガヒョンはカードに書かれたメッセージと同じ文章を「運命のかけらたち」の中に発見し、死者が発生する日を割り出すことに成功。連絡が取れないキム・セリンの家を訪れると、そこにはセリンに暴行を加えるジョンテの姿が。しかし、ジョンテは自分はハメられたと証言し…。

12年前の同じ日に父を亡くしたドウォンとソギョンは、それぞれ刑事と検事になっていた。ドウォンは、５年前に廃駅になったムギョン駅の線路で４体の白骨遺体を発見。すべての遺体には鈍器による頭蓋骨骨折の痕があり、その手口を知ったソギョンは、12年前に自分の父が犠牲となった殺人事件と同一犯の可能性を疑う。

ドウォンは、白骨遺体にソギョンの継母の連れ子、イ・ソンウクが関係していることを突き止める。過去の事故で頭に障害が残るソンウクからは有力な手掛かりを引き出せないが、ドウォンはソンウクが口走っていたいくつかの言葉を頼りに、事件には5人目の被害者がいると推測。ドウォンとソギョンはムギョン駅に向かう。

ソギョンは12年前に父を殺したのがソンウクだと思い込み、ソンウクを追い詰める。ところがドウォンは、事件の真犯人は自分の父だったと打ち明ける。混乱するソギョンは、さらに課長のオ・ミスクまでもがその事実を隠していたことに衝撃を受ける。ミスクは、すべては当時継母と義兄から虐げられていたソギョンを守るためだったと告げる。

ソンウクが逮捕されるが、ソンウクの母チョ・ヨンランは息子の無実を訴え、遺体に残された犯人のDNAもソンウクのものではなかった。ソギョンは白骨遺体の遺品のアクセサリーが12年前の事件で自宅から盗まれたものと知り、父を殺した真犯人はドウォンの父ではなく別にいると確信。一方、ドウォンの前に５人目の遺体と同一人物が現れ……。

ムギョン駅に向かったソギョンが何者かに殺害され、その現場には６人目の死体も遺棄されていた。証拠品に残された右手の指紋から麻薬ブローカーだったイ・ジンソンが浮かぶが、イには右手の指が２本なかった。ドウォンはソギョンが残したメッセージを聞き、ソギョンの父が殺された事件と一連の殺人事件は同一犯によるものだと知る。

ミスクはドウォンが常習的に薬を服用していることや、捜査方法が度を越していることを問題視し、停職を言い渡す。ソギョンの死を受け入れられないドウォンは絶望のなかムギョン駅へ行き自ら命を断とうとするが、そこへ走るはずのない列車が向かってくる。ドウォンはその列車にソギョンが乗っているのを目撃し、思わず列車に飛び乗る。

警官に追われて逃げるドウォンは、死んだはずのソギョンに銃を向けられ、殺人容疑で拘束された。自分が住む世界と全く同じもう一つの世界にいるのだと気づいたドウォン。もう一つの世界ではソギョンもドウォンも刑事だったが、ドウォンは汚職と麻薬に手を染めていて、ソギョンはドウォンを、父を殺した犯人の息子として憎んでいた。

もう一つの世界で殺されたイ・ジンソンの行動をたどるドウォンは、ジンソンが６人目の被害者の死体を目撃したことが原因で殺され、もう１人の自分はそれを追っていたと推測。必ず自らの手で真犯人を捕まえると誓う。もう一つの世界のドウォンの部下、ジェヒョクとジュニョンは、いつもと様子の違うドウォンに戸惑いを覚えていた。

どちらの世界でも12年前に同じ事件が起きていたが、ドウォンは自分の異なる選択によって、それぞれの世界の自分の運命が変わったのだと理解する。車両庫で自分が乗ってきた列車について調べていたドウォンは、もう１人の自分が同じ列車に乗っていて、互いの世界が入れ替わったと気づく。そこへ真犯人からの電話がかかってきて……。

ドウォンに恨みを抱くもう一つの世界のソギョンは、ドウォンの悪事を暴くためムギョン署に異動してくる。自分に冷たい刑事のソギョンだが、ドウォンは死んだソギョンへの思いから、思わず彼女を抱きしめる。ドウォンらが捜査を始めた失踪者は、元の世界で遺体で発見された６人目の被害者だった。容疑のかかった男を追うが……。

ドウォンは、容疑者として追っていた男が元の世界で部下のキム・ジヌだったことに衝撃を受ける。ジヌはかつて自分に冤罪をかけたドウォンを激しく恨んでいた。一方、ドウォンと入れ替わったもう一つの世界の汚職刑事ドウォンは、状況を把握し、自分がいた世界へ戻るためにムギョン駅へ。しかし、いつまでたっても変化は起こらない。

ソギョンのリストカットの痕が気になるドウォン。もう一つの世界では、自分の父が原因でソギョンが苦しんできたことに胸を痛める。ドウォンは被害者失踪の日に近所で見知らぬ車を見たというジヌの証言をもとに、あらためて現場を調べに行く。そんななか、留置場にいたジヌが脱走。ドウォンらは、ジヌのターゲットは別にあると気づく。

人権侵害の有無について調査をする人権増進委員会。ハン・ユンソは冷静に事実を判断する実力のある調査官だ。タサン市長が起こした秘書へのセクハラ事件も着実に証拠を集め、真実を突き止めていく。そんな中、検察でさまざまな騒ぎを起こし異動することになった検事のぺ・ホンテが人権増進委員会に出向してくる。性格が正反対の２人は対立してばかり。そこにテウン労組で起きたセクハラ事件が申し立てられる。当事者の主張は食い違い調査が難航していく。

テウン労組の組合員ソ・ジヘは同組合政策局長イ・ウンユルから受けたセクハラ事件の証拠音声を持ってくる。しかしその内容は決定的な証拠とは言い難く、調査は思うように進まない。そんな中、ジヘとウンユルの同僚であり、亡くなったカン・ユノが会社から名誉毀損で告訴されていた事実を知る。検事の勘が働いたホンテはユンソを説得し、カン・ユノの事件について調べ始める。一方、当事者のソ・ジヘは委員会の公開を強く要求するが…

フィリピン人のナデート・クミヤは刑務所の中で、無実を訴え自殺した。兄のサワディーはユンソを訪ね、弟の死の真相を明らかにしてほしいと懇願する。ナデートは韓国語の拙い外国人、共犯者と見られるチ・スングは境界知能を持つ青年であるにもかかわらず、警察は後見人を同席させずに虚偽の自白を強要させた疑いがあった。そんな中、代理申立人のオ・テムン弁護士が人権委を訪れる。オ弁護士はチ・スングの無実を主張するが…

ホンテとダルスクは事件の捜査を担当したユン警部補を訪ね、調査を進めていた。ユン警部補はチ・スングから犯人しか知り得ない具体的な証言を得たことや、スングが逃げるように住んでいた考試院を離れたことから捜査に間違いはなかったと主張する。しかしホンテは、警察が虚偽の自白を強要したという疑いを拭えず、スングが暮らしていた考試院へと向かう。そこにユンソも合流し調査を進めていくうちに、ある人物が浮かび上がる。

事件は高校時代の友人が久しぶりに集まった日に起きた。酒に酔い、けんかになったドンリョンとミョンデ。騒ぎは大きくなり、警察が出動しテーザー銃を向けて制圧していた。部屋に戻ってからも争いがエスカレートする中、チョン警部補がテーザー銃を発射し、ドンリョンは死亡する。チョン警部補は誤射だと主張するが、ドンリョンの友人たちは狙撃する姿を目撃したと陳述し、両者の主張は食い違っていた。疑われたチョン警部補は行方不明になり…

ナムチョンアパートで主婦のキム・ミヒが刃物で刺され遺体で発見される。現場で見つかった刃物からは、ミヒの夫であるヨン・ジュソクの指紋が検出された。しかし裁判で、その刃物は警察が違法に持ち出した物だったことが判明し、証拠は排除される。ホンテは有罪を立証すべく、新たな証拠を得るため捜査を進めていく。一方、強盗の容疑で緊急逮捕されたパク・ギスは適正な手続きを踏んでいない違法な逮捕だと主張し人権委に申し立てる。

非武装地帯で木箱地雷が爆発し陸軍第16師団の隊員が死傷する。この事故で一等兵のチョン・ナムスは死亡し、兵長のチェ・ドゥシクは脚を失ってしまう。同じく現場にいたイ・ソンウ少尉は隊員を救ったことで保国勲章を授与されマスコミにも注目されていた。一方、死亡したチョン一等兵の父ブソンは“木箱地雷事故はねつ造だ”という内容の電話を受ける。軍への不信感が募ったブソンは人権委に調査を依頼するが、機密事項の多い軍隊の調査は難航していく。