教育評論家の阿川将司（濱津隆之）の家に派遣された三田園薫（松岡昌宏）と本仮屋素子（山本舞香）。勤めていた家政婦が一気に辞めてしまったとのことで、急きょ依頼を受けた2人だったが、子どもがあまり得意ではない素子は、4人も子どもがいることに憂鬱そうな様子を見せる。

ある日の退勤中、突然数名の男たちによって連れ去られてしまった三田園薫（松岡昌宏）と本仮屋素子（山本舞香）。目を覚ますとその部屋にはなぜか、素子の父・靖男（飯田基祐）と母・佐和子（片岡京子）、そして靖男が勤める会社『ゴラク堂エンタープライズ』の専務・山本克己（小須田康人）や社長の川嶋明夫（小浦一優）らが同じように家族とともに閉じ込められていた。

とある高級タワーマンションの一室――出勤前の夫・前田則之（本多力）から「出かけるときはメッセージを」「GPSはオンにして」と細かく注文をつけられている前田翠（松本まりか）。うんざりしながらも笑顔で聞き流していた翠だったが、則之が出かけた途端、真顔に。

高級ブライダルサロン『セイ・イエス』のオーナー、幸田愛（真飛聖）の自宅に派遣された三田園（松岡昌宏）と実優（桜田ひより）。「『セイ・イエス』に行けば絶対離婚しない」というジンクスがあるほど人気のブライダルサロンで、結婚して10年になる夫の純（福井晶一）との夫婦仲も良好…に見えたが、三田園らが着任して早々、愛が純に「浮気の証拠＝カフェで不破倫子（野村麻純）に指輪を渡している写真」を突きつける場面に遭遇する！

田舎町で1人で暮らす老婆・田浦加代子（前田美波里）の家に派遣された三田園薫（松岡昌宏）と村田光（伊野尾慧）。そこに、亡くなった息子の妻・西園寺渚（横山めぐみ）と孫の康太（福山翔大）が引っ越してくることに…。「オレオレ詐欺」に引っかかり、300万円も騙し取られてしまった加代子を心配した渚が、一緒に住むことを提案したのだった。

ホテルやレストランなどを経営する天宮グループの社長・天宮雄一（伊武雅刀）宅へ派遣された三田園薫（松岡昌宏）と村田光（伊野尾慧）、矢口実優（桜田ひより）。天宮家の令嬢・天宮麗美（佐津川愛美）は、番組やネットで話題に上がるたびに会社の株価も上がるので、「株価を動かす令嬢」と呼ばれていた。

高森修作（中村梅雀）の家に忍び込んだ隣人の有坂凛（中島もも）は、書斎で金庫のロックを開けようとしているところを修作に見つかってしまう！　とっさに「迷い込んだ猫を探しに来た」と言い訳をした凛だったが、偶然高森家に派遣されていた三田園薫（松岡昌宏）は、凛が本当は猫など飼っていないことを察知。

竹和町の町長選挙に立候補している小杉太一郎（醍醐虎汰朗）の家に派遣された三田園薫（松岡昌宏）と矢口実優（桜田ひより）。当選すれば「史上最年少町長」となる太一郎は、地元・竹和町商店街の復活を政策に掲げており、商店街を潰し、大規模再開発を推進する現職の石黒潤三（福田転球）と対立していた。投票日を明日に控え、てんやわんやの太一郎宅。

「70歳以上は社会のコスパが悪くなるから日本から追い出せ」という発言で炎上したITベンチャー企業の社長・矢崎智（丸山智己）。アイドルとの不倫疑惑をスクープされて以来、表舞台から姿を消し、山奥にポツンと建つ一軒家で暮らしていた。そんな矢崎の妻・みゆき（映美くらら）からの依頼で、共に矢崎の自宅を訪ねることになった三田園薫（松岡昌宏）と村田光（伊野尾慧）。

ゴルフ界の若きスーパースター・羽井来斗（佐伯大地）がメジャー大会を前に突然「育休」を宣言する。時を同じくして、三田園薫（松岡昌宏）と村田光（伊野尾慧）が羽井家から依頼を受け、訪問。すると、来斗の妻・早苗（南沢奈央）が大きな荷物を手に泣きながら出てくる場面に遭遇してしまう！

森の中に佇む立派なお屋敷――桃山宗次郎（小野武彦）を当主とする桃山家に派遣されていた三田園薫（松岡昌宏）と矢口実優（桜田ひより）。長女の麗子（黒木瞳）とその夫・康介（宮川一朗太）、宗次郎の弟・哲平（有薗芳記）らが揃っての夕食を待つ中、服を真っ赤に染め、手に果物ナイフを握りしめた実優がフラフラと現れ、つぶやく。

ラーメン店を営む藤原家に派遣された三田園薫と霧島舞。

「結婚相手の母親が来るので、隅々まで掃除をして昼食の用意もしてほしい」という依頼を受けた三田園薫と霧島舞。

女性市長・飯塚麻由子が公費で沖縄旅行に出かけていたこと、そしてそれが“不倫旅行”だったこと、さらには高校生の隠し子がいることまでもが次々とSNSで暴露される。

東日本大震災で家族を失い、広島に住む17歳の高校生ハルは、一度も帰っていない故郷の大槌町へ向かう。

ある小さな町で、山の斜面から転がり落ちて息絶えた厚労省の医系技官・澤部保（小松利昌）の遺体が発見される。榊マリコ（沢口靖子）らが現場に駆け付けるが、藤倉刑事部長（金田明夫）から、遺体の解剖は、この町の診療所の先生に行ってもらうよう指示が。マリコは、過疎化の進んだ町に、法医認定医がいることに驚く。医師の名前は4年前にこの町にやってきた、町唯一のドクターである椿木陽（藤井隆）。法医認定医の資格を5年前に大阪の名門医大で取得したエリートだが、気弱な性格で、自信がないと渋って…。

とある池で女性の溺死体が見つかり、榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研メンバーが現場に臨場する。被害者は、ある町の前町長で、背中の圧迫痕から誰かに突き飛ばされた可能性があることなどが判明。さらに捜査を進めると、インターネット上には、前町長が推し進めた堤防工事の計画の凍結にまつわる黒いウワサが書き込まれた《フェイクニュース》であふれ、すごい勢いで拡散されていた。実は、数年前にこの町で起こった水害で多数の被害者が出ており、堤防工事が中止にならなければ悲劇は起きなかったと非難されていたのだ。

“公園で男性が焼死した”という知らせが科捜研に入った。駆けつけた榊マリコ（沢口靖子）に、京都府警刑事・土門薫（内藤剛志）が驚きの事実を告げる。目撃者によると、被害者は歩きながらスマートフォンで通話していたが、ベンチに座った瞬間、身体から火が噴き出したというのだ。しかも、そのまま微動だにせず燃え続けたらしい。

ある朝、榊マリコ（沢口靖子）は刑事部長・藤倉甚一（金田明夫）から緊急呼び出しを受けた。京都府内の大学の化学研究室のサーバーがハッキングされ、危険な毒ガスの製法データが盗まれたという。犯人はウェブ通話での交渉を要求、警察関係者でもいいから信頼できる第三者を交渉役に立てるよう伝えてきたらしい。

大学理工学部の学部長・兼平政則（山崎銀之丞）が、大学内の自室で死んでいるのが見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は遺体の手指に赤い発疹があることに気づき、アレルギーを疑う。まもなく、マリコの推測どおり、兼平はラテックス（天然ゴム）アレルギーで、過去にアナフィラキシーショックを起こしたことがあると判明。

漁港の廃棄物集積所に捨てられていた発泡スチロール箱の中から、人骨が見つかった。榊マリコ（沢口靖子）たち科捜研が鑑定にあたったところ、20代男性のものとわかった。肩甲骨の背面側に傷が残っていたため、鋭利な刃物で背中を切りつけられ、殺害されたものと思われた。白骨が入っていた発泡スチロール箱から、養殖業者の存在が浮上。

大学の“動物音声学研究室”に所属する助教・園山隆（佐伯新）が、研究用に飼育しているサルのケージの前で絶命しているのが見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、遺体の後頭部と前頭部にそれぞれ傷があることに気づく。おそらく何者かに正面から切りつけられ、その衝撃で転倒。後頭部を打ちつけたことが、致命傷になったものと思われた。

システム開発会社の社長・梶谷亮一（鈴之助）が、石段の下で転落死しているのが見つかった。榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研が鑑定したところ、何者かに突き落とされたものと思われた。付近の防犯カメラを確認したところ、意外な人物が映っていることが明らかになった。その人物とは…京都府警捜査第三課の篠宮小菊（松下由樹）。

乗馬ファームの厩舎の前で、馬主の吉川耕造（吉田輝生）が死んでいるのが発見された。榊マリコ（沢口靖子）が検視したところ、遺体の後頭部と前頭部に外傷が残されていることが判明。また、吉川が所有する馬“ウィンター号”が行方不明になっていることもわかる。ファームのスタッフによると、ウィンター号は元競走馬で、現在は乗馬体験や撮影などで活躍していたという。

イチョウの木の下で都内在住の船井文治（尾崎右宗）という男性の遺体が見つかった。着用していた装備から、ロープを使って木に登るアクティビティ“ツリークライミング”に興じていて不注意で落下したものと思われたが、臨場した榊マリコ（沢口靖子）は疑問を抱く。現場には多数の銀杏が落ちているにもかかわらず、被害者のスニーカーの底に銀杏を踏んだ痕跡がなかったのだ。

京都市内のビルの一室で、女性の遺体が発見された。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、驚愕する。現場のビルは、つい最近まで古久沢明（石黒賢）がひそかに属していた“シャドーラボ”が存在した場所だったのだ。そのシャドーラボは、海外の機関が日本人科学者を秘密裏に研究に従事させ、その成果を本国へ持ち帰るための“闇”の施設だった。

新年早々、人通りのない寂しい公園で、後頭部を強打され絶命した舞子姿の女性の遺体が発見される。臨場した榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研メンバーは、被害者が身に着けている帯に二次元コードが印刷されているのに気づく。コードを読み取ったところ、「デジタル舞子」というサイトにつながったから驚く。「デジタル舞子」は、アプリで手軽にオーダーできる、カジュアルなお座敷遊び風サービスらしく、被害者の身元はそのデジタル舞子のひとり、本条奈々（三澤紗千香）と判明する。

とある百貨店の商品企画部オフィスで、側頭部を殴打され絶命した女性の遺体が発見される。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は被害者の右手から、握られていた繊維片と、なにかベトベトとする謎の付着物を採取。早速、鑑定を始めるのだった。一方で、第一発見者である企画部のスタッフに聞き込み捜査をする土門薫刑事（内藤剛志）。

とあるキャンプ場で、頭部に傷を負い絶命している男性の遺体が発見される。被害者は、ソロキャンプ（＝ソロキャン）を楽しんでいた南郷朋親で、誰かに突き飛ばされ、後頭部を木に強打したことが死因らしい。また、被害者のそばにアウトドア用のコーヒーミルのハンドル部分が落ちており、ここから血液反応が…。被害者のものだろうか？その時、木陰から遺体を検視する榊マリコ（沢口靖子）たちを見つめる、フードを目深にかぶった“魔法使い”のような出で立ちの人影が。

榊マリコの住むマンションに、成分不明の爆発物を所持した銀行強盗3人組が逃げ込んだ。現場の部屋に潜入したマリコの機転によって爆発物の種類は特定され、誘拐された杉原夫妻の息子・卓海がマンション内のごみ集積場で、もう1人の犯人に囚われていることも分かる。