老舗フレンチ『シェ・オバタ』総料理長の池住政司が厨房で殺害された。榊マリコら科捜研メンバーが調べたところ前頭部に挫創があり、鈍器で殴られたものと見られた。

「10年前に人を殺しました。逮捕してください」――京都府警に地味な雰囲気の女が自首してきた。

廃墟に置かれた棺の中から、悪魔のコスプレを身に着けた男の遺体が見つかった。

料理評論家の富永栄吉が、自宅リビングで何者かに後頭部を殴られて殺害された。知らせを受けて臨場した榊マリコら科捜研メンバーは、アッと驚く。

タレントの成沢真弥が、新築の戸建て住宅で絞殺されているのが見つかった。第一発見者は、婚約者の織江雄吾。

関西を中心に展開する高級ホテルチェーンの経営者・柊恵子が、街の一角で後頭部から血を流して死んでいるのが見つかった。

京都市内のトンネルで、有名カメラマン・梶木譲士の遺体が見つかった。現場の状況から、被害者は別の場所で殺害され運ばれてきたものと思われたが、臨場した榊マリコは着衣に白い粉が付着しているのを発見する。

監察医・風丘早月（若村麻由美）の娘で大学生の亜矢（染野有来）が、科捜研を訪ねてきた。

榊マリコは監察医の風丘早月に誘われ、風丘の恩師である“プリンセス・トシコ”こと、新海登志子教授が講演するNPO法人主催のシンポジウム会場を訪れていた。

京都府警本部でウェブ会議システムを導入することとなり、榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研がモニターとして体験してみることになった。

榊マリコ（沢口靖子）に思いがけず“異動話”が舞い込んだ。警察庁で“刑事指導連絡室”室長を務める元夫・倉橋拓也（渡辺いっけい）が、刑事講習で科学捜査を教える専門指導官に、マリコを推薦したのだ。もし選ばれたら警察庁、つまり東京に出向となる…。科捜研の仕事を天職と思う一方、20年以上培ってきた科学捜査の経験を若い世代に伝えることにも価値があると考え、マリコは迷う。その倉橋が突然、マリコに相談を持ちかけてきた。

アパートの2階で、住人・佐々浦洋子（森口幸音）の刺殺体が見つかる。隣の部屋に住む北村沙織（奥山かずさ）が一緒に飲むため訪ねたところ、遺体を発見したという。土門薫（内藤剛志）刑事は通報時間が朝9時と早く、そんな時間から飲もうとしたのか尋ねる。さらに沙織が持参したワインボトルに洋子の指紋が大量に残っていたと告げると、沙織は顔をこわばらせ、仕事に行くと強引にその場を去ってしまう。

京都市内の路上で自転車が爆発し、乗っていた男性が死亡する事件が起きた。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、遺体を確認して驚く。被害者は大手IT企業社長・磐田誠一郎（西ノ園達大）で、マリコは先日、彼が主催する“スマホアプリコンテスト”を見学したばかりだったのだ。何者かが自転車に爆発物を仕掛けたようだったが、不可解なことにハンドルには7台ものスマートフォンがズラリと装着されていた。

寂れたビリヤードバーの店内で、経営者・横沢征（湯浅崇）が殺されているのが見つかった。横沢はあちこちで借金を重ねているらしく、遺体を発見したのも取り立てに来た金融業者だった。検視した榊マリコ（沢口靖子）は、横沢が薄汚れた身なりをしているにもかかわらず、靴だけがピカピカに磨き上げられていることに違和感を覚える。また、遺体の手のひらに油のようなものが付着していることにも気づく。

国際ピアノコンクールの日本最終予選の朝――。審査員長を務めるドイツ人女性の絞殺体が、会場のコンサートホールで見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、遺体の首に付着していた赤い微物を採取。また、遺体の歯の間に光る微物が挟まっているのを発見する。死亡推定時刻は前日の夜8時から10時の間と思われたが、ホール支配人によると、事件当日は午後、出場者3名が練習に訪れ、最後に調律師の和田優（崎山つばさ）がピアノの調律を行ったという。

繁華街の裏路地にあるバーの前で、店の常連客・横井友哉（松木賢三）の刺殺体が見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）たちは、遺体のポケットからかわいらしい僧侶のキャラクターがついたキーホルダーを発見。調べたところ、京都府中部に位置する“山田村”の公式キャラクターグッズだとわかる。

人気男性アイドルグループの追加メンバーを決めるオーディションの合宿場で、参加者の豊原輝（清水学）が額から血を流して死んでいるのが見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、被害者の口元にピンク色の繊維が数本、付着していることに気づく。また、遺体の付近には三角錐の形をした、謎のプラスチック片が転がっていた。グループのプロデューサー・サニー（斉藤陽一郎）によると、このオーディション合宿に参加していたのは、輝を含め７人。

最新鋭のAI（人工知能）を研究する“京都AIセンター”のサーバールームで、ネットニュースの記者・高階浩也（野田晋市）の遺体が見つかり、榊マリコ（沢口靖子）たち科捜研に出動要請が入った。火災通報があったため消防が急行して遺体を発見したのだが、火事の痕跡は現場にも遺体にもまったくなく、検視の結果、死因は二酸化炭素中毒と判明。現場には、二酸化炭素を放出して鎮火する二酸化炭素消火装置が設置されていた。

榊マリコ（沢口靖子）と宇佐見裕也（風間トオル）は、和歌山県の山中に新設された警察病院を訪れていた。最近、遺体に捜査員のDNAが付着するなどのミスが全国的に相次いだため、開業前のその病院を借り、近畿5府県の科捜研から法医、化学の担当研究員を各1名ずつ集めて研修が行われることとなったのだ。

山中で、和楽器の鼓を抱えたスーツ姿の男性の遺体が見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、被害者の頭部に爪あとのような謎の引っかき傷が残されているのを発見する。まもなく、被害者の身元は暴力団のフロント企業社員・才賀春樹（小堀正博）と判明。また、鼓は区民会館の備品であることがわかったほか、付着していた指紋から所轄署の生活安全課係長・高安順二（林家正蔵）が浮上する。

とある日の科捜研。橋口呂太（渡部秀）がにわかには信じられない様な話を始める。それは、知り合いの少年の元に、亡くなった父親の記憶を受け継いだという男が現れたというものだった。呂太に懇願され、榊マリコ（沢口靖子）は、その少年に会いに公園へと向かう。少年の父親は、大学准教授の賀茂井健治。一ヵ月前にとある境内の階段から転落死したが、「臓器提供意思表示カード」を所持していたためドナーとなることになった。

榊マリコ（沢口靖子）と涌田亜美（山本ひかる）は、ある山中で、動画投稿サイトで大人気のイケメン“ハンドラー＜訓練士＞”の斯波＜しば＞健三（奥野壮）と救助犬・ゾイのコンビ《ゾイケン》と出会う。健三はゾイの言葉がわかるという触れ込みで注目を集め、これまで多くの救助をゾイとともに成功させていた。そんなゾイケンは、マリコの目の前で要救助者の男・野口栄斗を発見するが、すでに絶命。マリコの検視の結果、彼は事故ではなく殺人事件の可能性が…。健三は被害者を見たことがないと言うが…。

橋口呂太（渡部秀）の恩師・勝又潤子（大島さと子）が校長を務める小学校の「科学クラブ」に招かれ、特別講師として榊マリコ（沢口靖子）たち科捜研メンバーは、授業を行うことに。すると、まるで“ミニ・マリコ”のような「科学クラブ」の女子児童が、教卓の裏にテープで留められている、血液反応のある不審なハンマーを発見。担当教師は、前日、準備をしている時は見かけなかったと答えるが…。児童たちは体育館に憑りついているとウワサされる幽霊“体育館のハナコさん”の仕業の可能性も示唆。

道路標識ではよく見かけるが、ほとんどの人は多くを知らない街…厚木。

ある日、凪はいつも通り、『畳み』のサービスを行っていた。

ランドリー茅ヶ崎では、今日も、凪が洗濯物を畳み、茅ヶ崎がアイロンをかけている。

いつもと同じ風景のランドリー茅ヶ崎…でもいつもよりざわざわしている店内… 今日も、かまってちゃんの劇団員、平野慎也が、ランドリー茅ヶ崎にやってきたのだ。

20世紀最高の小説家、フランツ・カフカはなぜか2019年の東京でアパート暮らしをしていた。小説では食えないからパン（生活）の為にパン屋でアルバイトをする日々。

「カフカ、猫ブームに絶望する」ある日アパートの前で子猫を拾うカフカ。大家さんにバレようとも、必死に愛しきカッツェ（独：猫の意味）を守ろうとする。

バイト先の仲間とキャンプに来たカフカ。大自然の開放的な空気の中、思い思いキャンプを楽しむ仲間たち。しかしアウトドアの才能が全くないカフカは、一人むなしく絶望する。