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オプティマスはプライムになった以降の記憶を失い、自分をオライオンパックスだと思いこんでいた。メガトロンは、サイバトロンの崩壊はラチェット率いるオートボット軍団の悪行のためだとオライオンにウソを話す。メガトロンは、かつてオートボットから奪ったアイアコンの記録文書の暗号が解読できずにいたが、オライオンを利用して、暗号解読をさせようとしていたのだ。ディセプティコンは前回と同じ軍研究施設を襲撃し、スペースブリッジの電力源を入手する。そんななか、スタースクリームがネメシスに侵入する。オライオンとはち合わせたスタースクリームは思わず「オプティマス・プライム」と、本当の名前を口にする。