初戦の失態によりクビを宣告されたジルだが、湧き上がる邪神討伐の意思は衰えないでいた…。

アーメイに救出されたクーパは、ジルたちのパーティに加えて欲しいと願い出るのだが…。

初戦を迎えたジルのパーティーは、強敵クサラックの前に苦戦を強いられてしまう…。

「近道の看板」を通過したジルたちは、様々な「罠」に行く手を阻まれるてしまう…。

ジルたち一行は、戦闘で壊滅状態にあったパーティからジジという老戦士を救い出す。

ドラゴンとの一大決戦に向けて、消極的なニーバをよそにジルは一人息巻くのだが…。

難病にかかったカーヤの特効薬を探すため、ジルは未知の領域に足を踏み入れる…。

細い支柱のみで構成されたフロアに足を踏み入れたジル一行は、風船型モンスターとの戦闘になり…。

生き残った登頂者たちの熾烈な戦いは、邪神の塔に新たな記憶を刻むのだった…。

絶対絶命のピンチに陥ったニーバを助けようと、ドルアーガに向かって走り出すジルだったが…。

ドルアーガとの戦闘で僅かな勝機を作り出すため、ジルは囮役を買って出るのだった。

ジルは「幻の塔」に入れるという謎の少女・カイの言葉を信じ、再び登頂の準備を始める。

金剛の宮まで訪れたジルたちを待っていたのは、経営者として成功したメルトだった。

天空の宮に到着したジルたち。そこに待ち受けていたのはまたも邪神ドルアーガだった。

ジルたちは、子供の影が次から次へと襲いかかってくる恐ろしいフロアに足を踏み入れる。

熱帯雨林のフロアで、グレミカ配下の暗殺者に狙われるジル。そこに新たな2人の刺客が現れて…。

目の前に現れた洋館でジルたちを待ち受けていたのは、死んだはずのアーメイやカリーだった。

湖のフロアを進むジルたちが到着したのは、巨大な竜の白骨が散乱する竜の墓場だった。

仲間の元に戻った時、ジルが目撃したのは何者かの攻撃に倒れたファティナたちだった。

カイを捕らえて一気に最上階を目指すニーバたちは、影の居城へと攻め込んでいく。

ニーバに遅れて王座の間に入ったジル。そしてついに、ギルとジルの決戦が始まった。

ついに真の姿を明らかにするドルアーガの塔。ジルたちの戦いの果てに見えるものは…。