「封神演義」の太公望として知られる姜子牙（きょう・しが）が立てた斉（せい）国――姜姓呂（りょ）氏が代々治めたこの国の運命を変える出来事は、こうして起こった。紀元前672年、陳（ちん）国の公子・陳完（ちん・かん）が内紛を逃れ、斉へと落ち延びた。斉国第16代君主で春秋五覇の１人である桓（かん）公は、ここに置いてほしいと言う逃亡者の願いを快諾。上卿を務めるよう伝えるも、恐縮して断る陳完に好感を持った桓公は、技官の長である工正の役目を与えるのであった。

戦国七雄のうち文化面で後れを取り、蛮夷と見なされていた秦（しん）国――後に天下を統一したこの国の転機は、“変法”によって訪れた。紀元前362年、秦国第25代君主としてえい渠梁（えい・きょうりょう）が即位した時、秦は存亡の機に瀕していた。魏（ぎ）国からの侵攻を受ける一方、国内では跡目争いが激化。不安定な状勢からの立て直しが迫られるなか、渠梁は才人の登用を宣言する。この窮地に現れたのが、魏を逃げ出た士人・公孫鞅（こうそん・おう）だった。旧習にしがみつく貴族に対し変化の必要性を説く彼に、渠梁は変法を命じ…。

「王位は第三王子の李琿圓（り・こんえん）に継承する」――朝堂に集った大臣たちの前で偽りの遺詔を読み上げた李漁（り・ぎょ）。同じ頃、渭（い）城の馬士襄（ば・しじょう）は、都からの便りがないことに焦っていた。彼は、第六王子・李琥珀（り・こはく）を早急に都へ帰還させて王位を継ぐべきだと、夏天（か・てん）に提案するが…。

李青山（り・せいさん）の後継者として国師となった何明池（か・めいち）を使い、大学士・曽静（そう・せい）をはじめとする太后派の排除を画策する新王・李琿圓（り・こんえん）。一方、李漁（り・ぎょ）は、華山岳（か・さんがく）を北方に派遣する。彼女の狙いは、夏天（か・てん）と李琥珀（り・こはく）を…。

重甲玄騎（ちょうこうけんき）は全滅した。唐（とう）は、隆慶（りゅうけい）と崇明（すうめい）が仕掛けた罠に落ち、都を守る精鋭部隊とせん植朗（せん・しょくろう）将軍まで失ってしまったのだ。おびただしい兵の屍で埋め尽くされた成京（せいけい）城にたどり着いた朝小樹（ちょう・しょうしゅ）は、単身、城内へ…。

降伏を迫る西陵（せいりょう）からの親書を読んだ李沛言（り・はいげん）は、慌てて何明池（か・めいち）に詰め寄る。しかし、「親王と西陵神殿の関係を公にしますよ」と返され、自分の愚かな行いを嘆くのだった。そんななか、隆慶（りゅうけい）率いる騎兵の一軍は、唐（とう）の東北部・土陽（どよう）城に迫りつつあった…。

金帳王庭（きんちょうおうてい）の軍に包囲され、渭（い）城は窮地に陥っていた。１人城門を出た夏天（か・てん）は、魔宗の術を使い、相手を翻弄する。敵の逆襲に遭い、討ち取られる寸前の彼女を救ったのは寧缺（ねい・けつ）だった。彼は渭城の兵と住民の脱出計画を練るが、馬士襄（ば・しじょう）は城に残ると言って聞かず…。

宮中侍衛統領・徐崇山（じょ・すうさん）と許世（きょ・せい）将軍の死。その背後に、何明池（か・めいち）の暗躍を感じ取った李漁（り・ぎょ）は、彼を戦地に送ることを決める。一方、夏天（か・てん）と李琥珀（り・こはく）を護衛して都への帰還の途上にあった寧缺（ねい・けつ）は、敵の気配を察知し、単独行動に出る…。

「寧缺（ねい・けつ）と公主の交渉が決裂すれば、羽林軍は突入してくるでしょう」――曽（そう） 府に身を寄せる夏天（か・てん）と李琥珀（り・こはく）の命は、２人の対話の結果にかかっていた。しかし、琿圓（こんえん）の退位を迫る寧缺と、李漁（り・ぎょ）の話は平行線をたどる。そして、彼らの身にも危険が…。

李琿圓（り・こんえん）が寧缺（ねい・けつ）に討たれたという知らせに、愕然とする崇明（すうめい）。しかし、隆慶（りゅうけい）の軍が足踏みをしていると知ると気を取り直し、弟に助太刀するため、すぐさま出立するのだった。一方、西陵（せいりょう）は、唐（とう）が内乱に陥ったと判断、侵攻を開始した…。

降伏を迫る西陵（せいりょう）の使者に対し、幼き新王・李琥珀（り・こはく）は「朕は受けて立つ」と徹底抗戦を宣言した。その頃、寧缺（ねい・けつ）は、陣眼杵（じんがんしょ）を受け取るために後山を訪れていた。しかし、都を守る驚神陣の鍵となる陣眼杵には傷がつけられており、それは徐々に広がっているのだという…。

知守観観主・陳某（ちん・ぼう）と李慢慢（り・まんまん）が対峙していた頃、後山は西陵（せいりょう）神殿の掌教・熊初墨（ゆう・しょぼく）の襲撃を受けていた。彼の前に立ちはだかった余れん（よ・れん）は、一気に５つの境界を越え、“知命巓峰（ちめいてんほう）”に至る。そればかりか、これまで秘めていた“正体”をさらし…。

“１尺の内に敵なし”と称される剣聖・柳白（りゅう・はく）を前に、己の力を見せつけた君陌（くんはく）。柳白は、君陌のおごりが命取りになるだろうと告げ、死力を尽くして戦う覚悟を決めるのだった。しばしの休息の後、今度は葉紅魚（よう・こうぎょ）が戦いの火ぶたを切る。彼女の放った万道剣光は、ひと時、君陌の動きを封じ…。

夫子（ふうし）亡き今、驚神陣を修復できる者はいないのではないか――莫山山（ばく・さんさん）の言葉に、寧缺（ねい・けつ）は落胆の色を隠せなかった。勝ち目は薄いと知りながらも、力を合わせ奔走する２人。一方、苦しい戦いを続ける君陌（くんはく）たちの前に、知守観の天下行走・葉青（よう・せい）が現れ…。

端午の季節が到来した。金如意は白素貞が蛇であることを暴こうともくろみ、許仙が白素貞に雄黄酒を飲ませるよう仕向ける。抵抗できずに雄黄酒を飲んだ白素貞はついに蛇の姿となり、その姿を見た許仙は衝撃を受け死んでしまう。金如意は後悔するがどうすることもできず、人身に戻った白素貞に全ての責任を背負わせる。許仙の死亡時、その場に白素貞がいなかったことで許嬌容は白素貞を薄情だと責め、良好だった関係にひびが入る。

白素貞は天界に到着し、仙女に成り済まして仙草を盗み出そうするが哮天犬（こうてんけん）に見破られて危うく西王母に処刑されそうになる。その時、運よく観音が現れて口添えをしたおかげで許仙を救う仙草を手に入れた。下界では金如意が許仙の姉をそそのかし、すぐにでも許仙を埋葬しようとするが、急ぎ戻った白素貞に阻まれる。更に法海の助けも手伝って許仙は息を吹き返した。

白素貞は許仙の治療のために心の血を犠牲にし、その様子を見た小青は心を痛める。だが許仙は相変わらず素貞と向き合えず、彼女を深く苦しめていた。その頃、許仙の姉は金如意の献身的な看病に心を動かされ、如意を許仙の嫁にしたいと思い始める。素貞は許仙が平穏無事に過ごせるならと意を決して離縁状をしたため、彼の元を離れた。許仙は素貞との記憶を失っても、やはり心を引かれ、思い出そうと努力し、如意を遠ざけようとする。

熱心に新居の準備をする金如意と許嬌容だったが、白素貞との関係について記憶を取り戻したい許仙は金如意を娶ることを拒否する。白素貞は別れを決心し、金如意に許仙を害すようなことをするとひどい目に遭わせると脅す。許仙と金如意の婚礼の当日、婚礼の衣装も着ずにいた許仙は街で傘をさす白素貞を見かけ、これまでの思い出がよみがえる。ついに妻を思い出した彼は誠心誠意、金如意に謝罪する。しかし諦められない金如意は、いちるの望みを抱いて側室でもいいと申し出る。

白素貞と小青は許仙の元に戻り、許仙は２人を温かく迎える。だが素貞は夫の言動が以前とはだいぶ変わったことに気づく。許仙は保和堂で蛇類の薬材を一切使わなくなり、薬草を重用した。また、しょっちゅう怪談小説を読んだりもしていた。素貞と小青は自分たちの正体を許仙に知られたと疑い、後をつけてみることに。すると彼は法海に会って自分の覚悟を伝えていた。

白素貞は術を使って許仙を峨眉山へと連れていく。許仙は景松が自分のために犠牲となったことを聞き、彼に深く感謝した。張玉堂は蛇を捕まえた際、小青に邪魔されて風邪をこじらせ、保和堂を訪ねるが、小青に不治の病だと脅される。許仙は張玉堂がこれ以上蛇を捕まえないよう、小青の嘘に話を合わせ、玉堂を保和堂で働かせることにした。保和堂では玉堂と小青のにぎやかな日々が始まる。

呂洞賓（りょ・どうひん）に扮した王道陵は、許嬌容に家の中に妖魔がいると告げ法術を見せて自分を信じこませる。許仙と白素貞は帰宅途中に医院に診療を拒否された皮膚のただれた老人に出くわし保和堂に連れ帰り心を込めて世話と治療をする。だがこの老人こそが本物の呂洞賓だった。呂仙人は許仙と白素貞夫婦の厚意に報いるため、許嬌容が家に持ち帰っていた天師令（てんしれい）を処理し、白素貞は危機から免れる。郊外にいた小青は張玉堂に助けられ彼に心を動かす。

白素貞は小青の情毒が張玉堂の命を奪うことを知っていた。そして、まだ修行の浅い小青の妖丹では小青も玉堂も守れないと判断し、許仙と話し合って２人を近づけないようにする。その一方で小青の実の父である東海竜王を訪ねて娘の恋をかなえるための協力を求めたが、拒否されてしまい、やむなく心を鬼にして２人の仲を引き裂こうとする。だが生来頑固な小青は初めての恋を実らせようと反抗し、張玉堂が自分を愛していると信じる。

小青は張玉堂の肉親捜しを手伝い、蘇州の名家、張家にたどり着く。生き別れた息子を捜していた張家も玉堂こそ張家の若様だと認める。しかし張夫人にとって息子を見つけた恩人は小青ではなく法海であった。張家を訪れた法海は張夫人を誘導して小青を貶めさせ、怒った小青は玉堂を置いて1人で保和堂へと戻る。その頃、許仙もまた、もう１人の法海と会っていた。法海の肉体は心の魔に乗っ取られ、張家に現れたのは心の魔のほうだったのだ。

小青と張玉堂は山の中で２人だけで親密に過ごす。だが夫婦となった翌日、張玉堂は目を覚まさない。白素貞が小青に何かあったと感じていた。ほどなく小青が現れ夫を助けて欲しいと懇願する。毒の回り方がこんなに早いとは思いもしなかった白素貞だが、竜宮から盗んできた忘情水（ぼうじょうすい）を小青に渡し、これを飲ませるのが彼の命を救う唯一の方法だと言い聞かせる。目覚めた張玉堂は小青を忘れてしまい、その後、新婦を迎える。

王道陵は金如意を苦しめる許仙を深く恨み、梁丞相をだまして共に許仙を倒そうとたくらむ。睦王妃が産気づいたのも王道陵の仕業だった。許仙に助産させて王妃と子の命を奪おうともくろむが、白素貞の優れた術で無事に切り抜けた許仙は名声を得る。許仙は妻の協力に感謝し、たとえ子がなくてもかまわないと言って素貞にからかわれる。たくらみに失敗した王道陵は次の策として死者に許仙を襲わせるが、金如意に制止された。

許仙は白素貞の協力で過去の両親と再会し、梁丞相の汚職の証拠を手に入れ、睦王と共に逆臣を倒すことに成功した。許家の汚名がすすがれたその時、許仙の姉、きょうようの妊娠が分かり二重の喜びとなった。金如意は再び許仙の家の前に現れ、弱っているふりをしてとどまろうと画策する。その頃、きょうようはすでに心の魔に取りつかれていた。心の魔は人間の負の感情を必要とするため、魔に操られたきょうようは如意を家にとどめた。

白素貞は許嬌容と嬌容のお腹の子の状況を許仙に知らせるが、許仙は白素貞が手出しすることを拒み夫婦は対立する。そのため白素貞は胎児を守りながら心の魔を阻止する解決方法を他に探すことにする。だが白素貞の気持ちを知らない許仙は法海を訪ね、白素貞の霊力を奪う丹薬を手に入れ白素貞に飲ませてしまう。伴生蓮花（はんせいれんか）があれば許嬌容と胎児を助けられると知った白素貞は咸池宮（かんちぐう）に伴生蓮花を盗みに行くが彼女の霊力は損なわれている。

白素貞は最後の力を振り絞ってきょうようの枕元にたどり着き、伴生蓮花を体内に送り込むが、法海はきょうようを傷つけられると誤解して禅杖で素貞を攻撃した。すると素貞の元神は耐えられずに散ってしまう。許仙は深く後悔した。更に法海の話から、素貞の霊力を抑えるために飲ませた霊丹が、実は金如意によって離魂散にすり替えられていたことを知る。許仙は毒を使って如意を罰するが、如意の父親である師匠への恩もあり命は助ける。しかしこれで２人の関係は完全に決裂した。

法海は白素貞を救う手段を見つけたが、それは許仙が素貞の夢幻に入り込んで彼女を現実へと引き戻すことだった。だがその方法は困難で許仙の命さえ奪いかねない。それでも許仙の決意は揺るがなかった。そしてついに、許仙の意志と真心が素貞を動かし、彼女を連れ戻すことに成功する。しかし許仙たちのいるじょか廟は、その時すでに臨安の人々に包囲されていた。人々は金如意の話を信じ、じょか廟にいる妖怪を退治しようと詰めかけたのだった。

文曲星君の母になるのが白素貞だと知った法海は、彼女を金山寺に連れ帰ろうとするが白素貞は小青を伴い許邸に戻る。真相を知った許嬌容も素貞と小青を自分の家族として喜んで迎える。だが臨安では白素貞と小青が妖蛇だといううわさが広がっていた。金如意が妊娠した。彼女は長く床を共にしていた相手が許仙に化けた王道陵だったと知ると同時に、自分の容姿が醜くなっていることに驚く。心の魔に惑わされた金如意は王道陵を殺し王道陵の妖丹を飲む。