ゴルフ界の若きスーパースター・羽井来斗（佐伯大地）がメジャー大会を前に突然「育休」を宣言する。時を同じくして、三田園薫（松岡昌宏）と村田光（伊野尾慧）が羽井家から依頼を受け、訪問。すると、来斗の妻・早苗（南沢奈央）が大きな荷物を手に泣きながら出てくる場面に遭遇してしまう！

森の中に佇む立派なお屋敷――桃山宗次郎（小野武彦）を当主とする桃山家に派遣されていた三田園薫（松岡昌宏）と矢口実優（桜田ひより）。長女の麗子（黒木瞳）とその夫・康介（宮川一朗太）、宗次郎の弟・哲平（有薗芳記）らが揃っての夕食を待つ中、服を真っ赤に染め、手に果物ナイフを握りしめた実優がフラフラと現れ、つぶやく。

依頼を受け、ウェブライターの田中令子（中山美穂）の家を訪れた村田光（伊野尾慧）と新人家政婦の大門桜（久間田琳加）。実は家政婦を依頼したのは、令子の夫・タカシ（ミスターちん）の母・和代（松金よね子）で、仕事にかまけて家のことを何もしない令子を牽制する意味もあった。突然のことに令子が戸惑っていた頃、庭の凍結した水栓から、水が噴き出す事態が！

小学校の《お受験》を間近に控えた石橋麻里子（橋爪未萠里）から家事サポートの依頼を受け、三田園薫（松岡昌宏）と大門桜（久間田琳加）が派遣される。息子・颯太の試験が明日に迫る中、家の中はてんやわんや。麻里子から母親の美恵子（藤真利子）と“パートナー”の慎太郎（渡部豪太）を紹介されるが、家政婦に対しても慎太郎に対しても「使えない人間はこの家にはいらない」という厳しい美恵子の姿勢に、桜は驚くばかりだった。

大手電機会社を定年退職した伊口慎二（竹中直人）の妻・茉莉花（山下容莉枝）からの依頼を受けた三田園薫（松岡昌宏）と大門桜（久間田琳加）。2人が家を訪問すると茉莉花の姿はなく、慎二が持ち帰った退職金2000万円とともに、こつ然と姿を消していた。家の周辺に世蔵剛（栄信）ら不良グループがうろついているのを見た慎二と桜が、茉莉花の誘拐を疑っている中、世蔵らが家に侵入してくる！

ミュージカルスターを夢見てレッスンに励む坂口雄太（加藤諒）――しかし夢は花開くことはなく、毎週後輩の鶴川太一（桑野晃輔）から金を借りてはギリギリの生活を続ける日々だった。ある日、鶴川から「金は貸せないけど、俺の代わりに家庭教師に行ってください」と言われた雄太。健康グッズ会社を経営する工藤耕一（神保悟志）の娘で、東都大法学部に入り弁護士を目指す理奈（田中珠里）のもとを“鶴川太一”として訪れることに…。

学習塾を営む山口家に派遣された三田園薫（松岡昌宏）と大門桜（久間田琳加）。娘の唯衣（松崎未夢）の内定祝いに美味しいご飯を作ってもらおうと、母の佐奈江（櫻井淳子）と兄の陽介（宇野結也）が依頼したのだ。そこで佐奈江は、唯衣と陽介に「実は紹介したい人がいる」と告げる。母の新たな門出に喜ぶ唯衣だったが、やってきた坂井守（野間口徹）という男性を見て愕然とする！

お城のような豪邸に娘3人と暮らす取目悦子（紫吹淳）からダンスパーティーの手伝いをしてほしいと依頼を受けた三田園薫（松岡昌宏）と村田光（伊野尾慧）。悦子の長女・里沙（花柳のぞみ）と穴（御子柴彩里）に迎えられた2人は、邸宅に“デレラ”と呼ばれる家政婦のような格好をした女性もいることを知る。

オカルト好きの中学生・桃子（住田萌乃）は、友達も少なく、いつも姉のさやか（山口まゆ）に手伝ってもらいながら、自分のチャンネルでオカルトについての動画を配信していた。ある日の配信終了後、姉から突然「結婚するから家を出ていく」と告げられた桃子は、『姉がいなくなったらひとりぼっちになってしまう』と思い、姉の結婚を阻止しようと企む。

義賊的な犯行を繰り返し、メディアやネット上ではヒーロー扱いされる「怪盗ねずみ花火」と呼ばれる窃盗犯――7年前の窃盗事件以来鳴りを潜め、まもなく事件は時効を迎えようとしていたが、時効を目前にして、とある児童養護施設に多額の寄付をする、という謎の動きを見せた。

聖（宮近海斗）が広島本社に転勤してから1年。小和（葵わかな）の薬指から聖にもらった指輪は消えていた。自分たちの選択は正しかったのか、どこで間違えたのか…忙しい日々の中、ふとした瞬間に、そんなことを考えてしまう小和。思い起こせば1年前――。遠距離恋愛が始まった当初は、ビデオ通話をしたり、たまに東京に戻ってきた聖と一緒に過ごしたり、離れていてもうまくいっていた2人。

ラーメン店を営む藤原家に派遣された三田園薫と霧島舞。

「結婚相手の母親が来るので、隅々まで掃除をして昼食の用意もしてほしい」という依頼を受けた三田園薫と霧島舞。

女性市長・飯塚麻由子が公費で沖縄旅行に出かけていたこと、そしてそれが“不倫旅行”だったこと、さらには高校生の隠し子がいることまでもが次々とSNSで暴露される。

東日本大震災で家族を失い、広島に住む17歳の高校生ハルは、一度も帰っていない故郷の大槌町へ向かう。

ある小さな町で、山の斜面から転がり落ちて息絶えた厚労省の医系技官・澤部保（小松利昌）の遺体が発見される。榊マリコ（沢口靖子）らが現場に駆け付けるが、藤倉刑事部長（金田明夫）から、遺体の解剖は、この町の診療所の先生に行ってもらうよう指示が。マリコは、過疎化の進んだ町に、法医認定医がいることに驚く。医師の名前は4年前にこの町にやってきた、町唯一のドクターである椿木陽（藤井隆）。法医認定医の資格を5年前に大阪の名門医大で取得したエリートだが、気弱な性格で、自信がないと渋って…。

とある池で女性の溺死体が見つかり、榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研メンバーが現場に臨場する。被害者は、ある町の前町長で、背中の圧迫痕から誰かに突き飛ばされた可能性があることなどが判明。さらに捜査を進めると、インターネット上には、前町長が推し進めた堤防工事の計画の凍結にまつわる黒いウワサが書き込まれた《フェイクニュース》であふれ、すごい勢いで拡散されていた。実は、数年前にこの町で起こった水害で多数の被害者が出ており、堤防工事が中止にならなければ悲劇は起きなかったと非難されていたのだ。

“公園で男性が焼死した”という知らせが科捜研に入った。駆けつけた榊マリコ（沢口靖子）に、京都府警刑事・土門薫（内藤剛志）が驚きの事実を告げる。目撃者によると、被害者は歩きながらスマートフォンで通話していたが、ベンチに座った瞬間、身体から火が噴き出したというのだ。しかも、そのまま微動だにせず燃え続けたらしい。

ある朝、榊マリコ（沢口靖子）は刑事部長・藤倉甚一（金田明夫）から緊急呼び出しを受けた。京都府内の大学の化学研究室のサーバーがハッキングされ、危険な毒ガスの製法データが盗まれたという。犯人はウェブ通話での交渉を要求、警察関係者でもいいから信頼できる第三者を交渉役に立てるよう伝えてきたらしい。

大学理工学部の学部長・兼平政則（山崎銀之丞）が、大学内の自室で死んでいるのが見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は遺体の手指に赤い発疹があることに気づき、アレルギーを疑う。まもなく、マリコの推測どおり、兼平はラテックス（天然ゴム）アレルギーで、過去にアナフィラキシーショックを起こしたことがあると判明。

漁港の廃棄物集積所に捨てられていた発泡スチロール箱の中から、人骨が見つかった。榊マリコ（沢口靖子）たち科捜研が鑑定にあたったところ、20代男性のものとわかった。肩甲骨の背面側に傷が残っていたため、鋭利な刃物で背中を切りつけられ、殺害されたものと思われた。白骨が入っていた発泡スチロール箱から、養殖業者の存在が浮上。

大学の“動物音声学研究室”に所属する助教・園山隆（佐伯新）が、研究用に飼育しているサルのケージの前で絶命しているのが見つかった。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、遺体の後頭部と前頭部にそれぞれ傷があることに気づく。おそらく何者かに正面から切りつけられ、その衝撃で転倒。後頭部を打ちつけたことが、致命傷になったものと思われた。

システム開発会社の社長・梶谷亮一（鈴之助）が、石段の下で転落死しているのが見つかった。榊マリコ（沢口靖子）ら科捜研が鑑定したところ、何者かに突き落とされたものと思われた。付近の防犯カメラを確認したところ、意外な人物が映っていることが明らかになった。その人物とは…京都府警捜査第三課の篠宮小菊（松下由樹）。

乗馬ファームの厩舎の前で、馬主の吉川耕造（吉田輝生）が死んでいるのが発見された。榊マリコ（沢口靖子）が検視したところ、遺体の後頭部と前頭部に外傷が残されていることが判明。また、吉川が所有する馬“ウィンター号”が行方不明になっていることもわかる。ファームのスタッフによると、ウィンター号は元競走馬で、現在は乗馬体験や撮影などで活躍していたという。

イチョウの木の下で都内在住の船井文治（尾崎右宗）という男性の遺体が見つかった。着用していた装備から、ロープを使って木に登るアクティビティ“ツリークライミング”に興じていて不注意で落下したものと思われたが、臨場した榊マリコ（沢口靖子）は疑問を抱く。現場には多数の銀杏が落ちているにもかかわらず、被害者のスニーカーの底に銀杏を踏んだ痕跡がなかったのだ。

京都市内のビルの一室で、女性の遺体が発見された。臨場した榊マリコ（沢口靖子）は、驚愕する。現場のビルは、つい最近まで古久沢明（石黒賢）がひそかに属していた“シャドーラボ”が存在した場所だったのだ。そのシャドーラボは、海外の機関が日本人科学者を秘密裏に研究に従事させ、その成果を本国へ持ち帰るための“闇”の施設だった。

榊マリコ（沢口靖子）ら京都府警科捜研に、京都市役所からの人事交流で会計係・加瀬淳平（加藤諒）が派遣されてきた。加瀬は科捜研がどんな鑑定をして、どれほど予算を使うのか興味津々な様子で…。

食品加工会社社員・門脇卓（真丸）の遺体が公園の石段の下で見つかり、榊マリコ（沢口靖子）たち科捜研メンバーは臨場。所持していたはずのスマートフォンが見当たらなかったことから、事件性を疑った捜査一課刑事・土門薫（内藤剛志）たちは捜査を開始する。事件の夜、門脇は“あかぞら食堂”という飲食店に寄ると言いのこして退社したことが判明、食堂を訪ねたマリコたちは店主の新倉初美（西尾まり）が“もう一度食べたい思い出の料理”を再現するサービスを行っていることを知る。

“城南市”まで証拠品の返却に赴いた榊マリコ（沢口靖子）は、階段を駆け下りようとした女性がよろけて転落する場面に遭遇。驚いて駆け寄った瞬間、マリコは彼女から甘い匂いが漂うのを感じ取ったほか、「ぼろの中に…」とつぶやくのを耳にする。マリコがすぐに救急要請したため彼女は一命をとりとめたが、意識は戻らず、予断を許さない状況が続いていた。翌日、城南市職員・紅林治彦（山本圭祐）の遺体が廃工場で見つかった。

榊マリコ（沢口靖子）は京都府警本部長・佐伯志信（西田健）の依頼で、今、ネットで“幽霊屋敷”と話題をよんでいる廃屋を調べることになった。噂のせいで不法侵入が止まず、警察にも苦情が相次いでいることから、“心霊現象など存在しない”と科学で証明してほしいというのだ。深夜、涌田亜美（山本ひかる）、加瀬淳平（加藤諒）とともに幽霊屋敷に乗り込んだマリコは、心霊現象を次々と科学で解明。